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席瑞斌

席瑞斌

席瑞斌

  • 研究员、博士生导师
  • ruibinxi@math.pku.edu.cn
  • 北京大学数学科学学院理科一号楼 1575
  • 北京大学
个人简介

教育背景

1998. 9 - - 2002.7 内蒙古大学数理基地(学士)

2002.9 - - 2005.7 北京大学数学科学学院(硕士)

2005 .9- - 2009. 8 圣路易斯华盛顿大学数学系(博士)

工作经历

2009.8- - 2012.7 哈佛大学医学院(助理研究员)

2012.9- - 北京大学(研究员)

获奖及荣誉

Best Poster Award in Asian Pacific Bioinformatics Conference ,2016

Robert Bohrer Award for Student Papers in Statistics, University of Illinois,2007.

Judith Ross Scholarship in Mathematics & Physics, Washington University in St. Louis, 2007.

Second Prize in China Undergraduate Mathematical Contest in Modelling,2000 & 2001.

学术兼职

中国现场统计研究会 理事

中国现场统计研究会计算统计分会 常务理事

 

主要研究方向

主要有两大研究方向:

发展新的统计理论和算法,来解决生物、医学、计算机领域的问题;

基因组学和生物信息学,比如研究癌基因组测序数据及单细胞测序数据等。

代表性科研项目

国家重点研发计划(2017.1-2021.12),批准号 2016YFC0207705,

污染与宏观经济、人口健康的计量分析,负责 43 万元,参与

国家自然科学基金重点项目 (2016.1-2020.12),批准号 71532001,大数据驱动的管理决策模型与算法,负责 32 万,参与

国家自然科学基金面上项目(2015.01-2018.12),批准号 11471022,基于高通量测序数据研究基因组变异的统计问题,60 万,主持

国家科技部 973 项目(2015.01-2019.12),批准号 2015CB856000,非结构数据的统计学习:数学基础及算法,负责 58 万元,参与

2013 年北京大学-微软联合实验室基金,高维数据的非线性降维,3 万元,主持

北京大学 985 经费(2013.01-2015.12),癌基因组数据的统计分析,30 万元,主持

 

10篇代表性论文

 

1.Xia,Y., Liu, Y., Deng, M.and Xi, R.* (2018+) Detecting virus integration sites based on multiple related sequencing data by VirTect, BMC Medical Genomics,Accepted.

2.Xia, Y., Liu, Y., Deng, M.and Xi, R.* (2017) SVmine improves structural variation detection by integrative mining of predictions from multiple algorithms, Bioinformatics, 1;33(21):3348-3354.

3.Yuan, H.Xi, R.*, Chen, C.and Deng, M.* (2017) Differential network analysis via lasso penalized D-trace loss, Biometrika, 104 (4):755-770.

4.Xia, Y., Liu Y., Deng, M.and Xi, R.* (2017) Pysim-sv: a package for

simulating structural variation data with GC-biases, BCM Bioinformatics,18(Suppl 3):53.

5.Xi, R.*, Lee, S., Xia, Y., Kim, T.and Park, P.* (2016) Copy number analysis of whole-genome data using BIC-seq2 and its application to detection of cancer susceptibility variants, Nucleic Acids Research, 44(13): 6274-86.

6.Xi, R.*, Li, Y.and Hu, Y.(2015) Bayesian quantile regression based on the empirical likelihood with spike and slab priors, Bayesian Analysis,11(3):821-855.

7.Xi, R.and Lin, N.* (2015) Direct regression modelling of high-order moments in big data, Statistics and Its Interface, 9(4):445-452.

8.Yang, L., Luquette, L.J., Gehlenborg, N., Xi, R., Haseley, P.S., Hsieh, C.H.,Zhang, C., Ren, X., Protopopov, A., Chin, L., Kucherlapati, R., Lee, C.and Park P.J.* (2013) Diverse mechanisms of somatic structural variations in human cancer genomes, Cell, 153(4):919-929.

9.Xi, R., Lin, N., Chen, Y.* and Kim, Y.(2012) Compression and aggregation of Bayesian estimates for data intensive computing, Knowledge and Information Systems, 33(1):191-212.

10.Xi, R., Hadjipanayis, A.G., Luquette, L.J., Kim, T.M., Lee, E., Zhang, J.H.,Johnson, M.D., Muzny, D.M., Wheeler, D.A., Kucherlapati, R., and Park, P.* (2011) Copy number alteration detection in sequencing data using the Bayesian information criterion, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA,108(46):E1128-1136.